自東晉以來，金門即有中原人士避禍屯墾於此，由於開發甚早，歷代文風鼎盛，產生豐富的文化風貌，全臺有將近1/10受到文化資產保存法指定登錄的古蹟和歷史建築座落在金門地區，其中並有多處位於金門國家公園範圍內，例如瓊林蔡氏祠堂、水頭黃氏酉堂別業、文臺寶塔、虛江嘯臥碣群等國定古蹟；金門雙乳山坑道、古寧頭北山古洋樓、元太武山築寨砌路摩崖石刻、前水頭黃輝煌洋樓及得月樓、珠山下三落、漢影雲根碣、古龍頭振威第、古龍頭水尾塔、邱良功墓園、瓊林一門三節坊、蔡攀龍墓、海印寺石門關、文應舉墓、李光顯故居及墓園等縣定古蹟，及其它超過40處的歷史建築。
更多指定登錄文化資產之最新資料，可參閱文化部文化資產局「國家文化資產網(https://nchdb.boch.gov.tw/)」。