国立公園設立の目的は、主にその国特有の自然風景や野生の動植物、史跡を保護して、科学の研究、教育、レクリエーション、知的啓発などの資産とすることにあります。（資源の永続利用）。
金門は、その特殊な地理的環境及び歴史に起因して、史跡、伝統集落、戦役記念品及び自然資源が多く残されています。このため、政府は、民国82（1993）年に、戦地政策を解除した後、国立公園を設立する構想を練り始め、民国84（1995）年10月18日正式に金門国立公園管理所を設立して、その経営管理を行ない、金門の豊かな文化資産、特殊な戦役記念品及び多様な自然生態系を永久に保存し活用していくことにしたのです。