關鍵詞：頭索動物亞門、活化石、廈門
一、 研究計畫緣起
除了古蹟與戰地特色外，金門過去受到長時間戰地政務的關係影響，限制了經濟開發，但也因此相對保留了許多生物的棲息空間。例如台灣地區已絕跡的水獺與大鱗細鯿。金門的海域除了鱟外，文昌魚也是其特色物種之一，文昌魚在演化上具有獨特的地位，素有“活化石＂之稱，主要分布在溫帶到熱帶的砂質底淺海域，中國廈門一帶水域的文昌魚族群數量最為豐富，曾經成為當地特殊的一項重要漁業資源。然而近年由於大陸沿海地區的經濟開發與環境的變遷，導致文昌魚棲地的破壞，使得文昌魚族群銳減，因此中國大陸於1991 年已將文昌魚列為國家二級保護動物。金門地區近年來屢次發生大陸漁民非法入侵大、小金門之海域採捕文昌魚及抽取海砂之事件，以致造成金門海域生物資源及棲地之破壞甚鉅，亟需予以調查了解，並制定保育及復育之措施。本研究計畫延續99 年度對金門文昌魚的調查，將蒐集及調查金門國家公園及鄰近水域文昌魚分佈的基礎資料，並與兩岸漁業管理單位與文昌魚的學者專家進行交流協商，以便未來擬訂文昌魚之保育及復育方針。
二、研究方法及過程
本研究工作利用金門水產試驗所提供的研究船或是租用的民間漁船於101 年5 月至9 月間進行野外調查工作。於金門水域，設置了的53 個樣點進行調查。野外調查除了利用底拖網具與浮游動物網捕抓文昌魚外，也收集採樣點的底質，並將底質帶回實驗室後進行粒徑分析。此外也利用101 年3 月5-9 日於廈門舉辦「第四屆水環境科學研究高校聯盟研究生論壇」(The 4th University Consorhium of Aquatic
Sciences Postgraduate Symposium)之機會，與中國大陸文昌魚研究的學者專家、政府官員進行交流蒐集相關資料。
三、重要發現
金門海域中大多數調查地區的底質其實已經不適合文昌魚的棲息。此一現象說明了為何在調查中所捕獲的文昌魚非常稀少的原因。除了料羅灣一側可能因所受的人為干擾壓力較低，還保有少數較穩定且豐富數量的文昌魚外，其餘地區的文昌魚分布相當稀少。
四、主要建議事項
根據本研究結果，提出下列具體建議。以下分別從立即可行、及中長期性建議加以列舉。
立即可行建議：
主辦機關：金門國家公園管理處
協辦機關：中華民國溪流環境協會
（一）調查結果可納入更新解說資料
（二）加強文昌魚的群眾教育和促進更多的公眾參與
（三）文昌魚種苗在金門的人工培育
中長期建議：
主辦機關：金門國家公園管理處
協辦機關：中華民國溪流環境協會、中央研究院、金門縣水產試驗所
（一） 金門海域文昌魚的保育區規畫設立與管理
（二） 金門海域污染物排放的監測和取締
（三） 文昌魚族群的監控與族群數量的回復計畫
（四） 金門、廈門的兩岸文昌魚保育復育合作工作
（五） 規劃其他文昌魚可能棲息海域為文昌魚的新復育場所