2021年調查結果發現，金門地區的兩棲爬行動物物種計有17科23種。其中，無尾目有5科6種、龜鱉目有3科5種、有鱗目有9科12種。調查到保育類有金龜、柴棺龜、草花蛇、唐水蛇、鉛色水蛇5種，柴棺龜、斑龜、紅耳泥龜、與斑腿樹蛙4種外來種。
在各類群物種調查數量上，無尾目1122隻次（目視遇測法468隻次、鳴叫計數法654隻次），以黑眶蟾蜍的數量最多443隻次，其次為小雨蛙392 隻次。
利用目視記錄到龜鱉目133隻次，陷阱捕抓記錄到114隻次，合計247隻次，目視紀錄以紅耳泥龜的數量最多76隻次，其次為金龜31隻次;陷阱紀錄以金龜數量最多31隻次，其次為斑龜14隻次。利用目視記錄到有鱗目1329 隻次，樣站外有鱗目則記錄到14隻次，共計1343隻次。以無疣蝎虎數量最高1163 隻次，其次為梅氏壁虎107 隻次。