本案總執行時程自111年01月01日起至111年12月20日止，擬定於一年的計畫期程執行以下各項工作：
一、於金門地區進行重要物種生物資料整理、田野調查、現地探勘等，調查其變遷與影響，提供本處解說教育、保育研究等使用。
二、延續過去金門國家公園長期監測之資料，進行金門重要物種及濕地生物等監測。
1.特色物種監測：包括金門水韭、食蟲植物、老鼠簕、黃邊鳳蝶及三棘鱟等
2.金門的猛禽監測(含黑翅鳶)：區分為金門東半島、西半島及烈嶼地區等。
3.金門的鳥類群聚監測：包括慈湖(國家級)重要濕地鳥類群聚、浦邊沿海鳥類群聚、浯江溪口鳥類群聚及陵水湖等重要濕地鳥類群聚。
三、調查重要動植物生態及其環境背景之關連，並與過往資料進行比較，了解物種族群變動情形，做為金門國家公園從事環境教育解說之題材。
四、提供重要生態棲地維護、規劃或後續經營管理之具體建議。